北海道大学医学部 Bioinfo研究会

北海道大学医学部 Bioinfo研究会 #

このサイトでは,勉強会で学習した内容をブログ形式でまとめています.


Recent News


勉強会の特徴 #

トランスクリプトーム解析を中心とした勉強会 #

  • bulk RNA-seq解析、scRNA-seq解析を中心とします。
  • ゆくゆくはATAC-seq解析などマルチオミクス解析にも対応する予定です。

AIエディタを中心とした解析環境の統一 #

  • VSCodeというエディタにAI支援機能であるGithub Copilotを導入することでプログラミング初心者でもすぐに解析を始められます。
  • 解析環境の統一により、勉強会で学習した内容をそのまま実践できます。
  • 何か詰まった場合でも環境が同じなので、質問しやすく解決しやすいです。

ハイブリッド開催 #

  • 実地での開催が基本ですが、Discordを活用してオンラインでも参加できるようにします。
  • 資料はすべてこのサイトにアップしてあるので自習およびDiscordでの質問が可能です。

Discordサーバー #

  • 勉強会に興味がある方はぜひ以下のDiscordサーバーに参加してください。
  • 質問や雑談などもDiscordで行う予定です。

参加希望者は下記へ連絡をお願いします。

hokudai.bioinfo@gmail.com

使用するエディタの変更について(2025/06/20) #

  • もともとCursorというエディタを使用していました。
  • しかし、アップデートに伴って統一環境を作成するための機能に大幅な変更があり挙動が不安定になってしまったため使用を中止することとしました。
  • VSCodeに移行しAI支援機能を追加する方式に変更しています。